Proses operasi cerek tindak balas biasanya bermula dengan mengecas bahan mentah. Bahan tindak balas dimasukkan ke dalam kapal melalui salur masuk, selepas itu salur masuk dimeterai dan sistem pengadukan diaktifkan. Sistem pengadukan menggunakan bilah atau turbin berputar untuk mencampurkan bahan tindak balas secara seragam-menghalang kawasan kepekatan yang terlalu tinggi atau rendah-dengan itu memastikan tindak balas berjalan secara sama rata.
Seterusnya, suhu dalaman dikawal menggunakan sistem pemanasan atau penyejukan. Kawalan suhu adalah faktor kritikal dalam proses tindak balas, kerana ia secara langsung mempengaruhi kadar tindak balas dan kualiti produk. Sebagai contoh, sesetengah tindak balas memerlukan suhu tinggi untuk mempercepatkan proses, manakala yang lain memerlukan suhu rendah untuk menghalang tindak balas sampingan. Kaedah pemanasan termasuk pemanasan elektrik, stim atau minyak terma, manakala penyejukan biasanya dicapai melalui air penyejuk yang beredar atau media penyejukan lain.
Tekanan adalah satu lagi parameter penting semasa tindak balas. Untuk tindak balas yang melibatkan atau menghasilkan gas, keadaan tekanan tertentu mesti dikekalkan. Cerek tindak balas biasanya dilengkapi dengan penderia tekanan dan injap keselamatan untuk memastikan tekanan kekal dalam julat yang selamat. Reka bentuk mekanisme pengedap adalah penting untuk mengekalkan tekanan; kaedah pengedap biasa termasuk pengedap mekanikal dan pembungkusan kelenjar.
Setelah tindak balas selesai, produk dilepaskan melalui saluran keluar. Sesetengah cerek tindak balas juga dilengkapi dengan sistem pembersihan untuk mengeluarkan bahan sisa selepas setiap penggunaan, dengan itu menghalang-pencemaran silang.
